Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pan3Q640Q5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pan3Q640Q5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pan3Q640Q5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pan3Q640Q5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pan3Q640Q5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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