Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga3Q62470 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms