Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttf1Q62187 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf1Q62187 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms