Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AlcamQ61490 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AlcamQ61490 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms