Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bbs12Q5SUD9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms