Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syndig1lQ3USQ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms