Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rspo3Q2TJ95 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rspo3Q2TJ95 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms