Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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