Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1EQ15878 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1EQ15878 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms