Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP4Q15650 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP4Q15650 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms