Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B3Q15393 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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