Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLCA4Q14CN2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms