Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem52bQ0VBF2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms