Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cnn1Q08091 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cnn1Q08091 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cnn1Q08091 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnn1Q08091 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms