Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms