Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms