Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan5P62080 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms