Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strn4P58404 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms