Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab2aP53994 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms