Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms