Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E1P51965 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E1P51965 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms