Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
SMARCA4P51532 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA4P51532 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms