Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms