Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms