Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl13P47963 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl13P47963 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl13P47963 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms