Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp12P34960 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp12P34960 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms