Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lef1P27782 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms