Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01798 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01798 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01798 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01798 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01798 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01798 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01798 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01798 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01798 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01798 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01798 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms