Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms