Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms