Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NlkO54949 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NlkO54949 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NlkO54949 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NlkO54949 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NlkO54949 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NlkO54949 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NlkO54949 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms