Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm8356J3QPD3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms