Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1bF6V0H0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms