Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rd3lB2RV38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms