Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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1700042G07RikB1AUF7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
1700042G07RikB1AUF7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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