Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htra4A2RT60 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms