Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms