Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCOA3Q9Y6Q9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCOA3Q9Y6Q9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms