Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DERAQ9Y315 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DERAQ9Y315 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms