Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mixl1Q9WUI0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms