Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb3Q9R1P1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb3Q9R1P1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms