Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsjQ9R014 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms