Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rai2Q9QVY8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rai2Q9QVY8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms