Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr4Q9QUK6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms