Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDAP2Q9NXN4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDAP2Q9NXN4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms