Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cul3Q9JLV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.5 ms