Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Kcnip1Q9JJ57 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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