Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHARPINQ9H0F6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms