Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan4Q9DCK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan4Q9DCK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms