Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms